鑑於生物產業科技已趨向自動化，所以生物產業機電科在校三年內安排了一系列的課程，其目標如下：

• 生物產業機電科之宗旨在培育學生機電整合之知識與技能，並將其應用在生物產業之發展為目標。

• 傳授生物產業機電之基本知識與技能。

• 授予生物產業科技之基本知識與技能。

• 訓練生物產業自動化機械之操作與維護、管理之技能。

• 科技的應用是職業知能的傳授；人本教育，職業道德，注重啟發思考，才更能提昇生命的品質。